Приложение 5
к МР 3.1.0272-22
ИНСТРУКЦИЯ ПО РАБОТЕ С ПРОГРАММОЙ GENOME.CRIE.RU
Интерфейс работы с образцами.
Версия 1.4.0.
Управление документом
| Авторы | ФБУН ЦНИИ Эпидемиологии, Информационно-аналитический отдел. |
| Файл | |
| Создан | 06.02.2021 |
| Последнее редактирование | 03.03.2021 |
| Количество страниц | 11 |
| Версия | Дата изменения | Описание изменения | Автор изменения |
| 1.0.0 | 08.02.21 | Составлена первая версия инструкции | Евстифеев Е.А. |
| 1.1.0 | 10.02.21 | Обновлены скриншоты из программы | Евстифеев Е.А. |
| 1.1.0 | 10.02.21 | Добавлено дополнительное описание при заполнении формы единичной загрузки | Евстифеев Е.А. |
| 1.2.0 | 03.03.21 | Обновлено описание полей реестра. | Евстифеев Е.А. |
| 1.3.0 | 28.04.21 | Добавлено описание для работы региона, выделено в отдельную инструкцию. | Евстифеев Е.А. |
| 1.4.0 | 07.05.21 | Обновлено описание по меню | Евстифеев Е.А. |
Предназначение системы
Проект — Российская платформа агрегации информации о геноме.
Задача системы — обеспечение быстрого доступа к данным об эпидемиях и пандемических вирусах.
Реализация проекта направлена на быстрый обмен данными по вирусу, в частности, по коронавирусу, вызывающем COVID-19. Это включает генетическую последовательность и соответствующие клинические и эпидемиологические данные, связанные с вирусами человека, а также географические и иные данные, связанные с вирусами. Это позволяет исследователям понять, как вирусы развиваются и распространяются во время эпидемий и пандемий.
Предоставление доступа
Доступ представляет собой ссылку на адрес для входа, логин и пароль. Доступ предоставляется посредством электронного обмена.
Авторизация в системе
При входе в систему появляется окно с запросом на авторизацию. В окне необходимо ввести логин и пароль, предоставленные пользователю, затем нажать кнопку «Войти»:
Основное окно программы для работы с образцами
Данное окно доступно только для авторизованных пользователей, обладающих правами по работе с образцами.
В нем доступен следующий функционал:
| 1. Новый образец |
|
2. Образцы |
|
3. Реестр образцов |
|
3.1. Создать реестр |
|
3.2. Список реестров |
1. Новый образец
По нажатию на данный пункт открывается окно оформления нового образца:
После загрузки файла и заполнения данных система отобразит окно об успешности загрузки:
Затем можно сразу начать оформление нового образца, либо посмотреть результат сохранения в разделе «Образцы».
2. Образцы
В данном разделе представлены все образцы с их статусами. По мере прохождения по процессу обработки образца статус будет изменяться. В правом верхнем углу расположена кнопка «Отчеты». Она позволяет выгружать данные, которые отображены на экране, в виде отчета.
Таким образом, есть возможность сформировать отчет и получить результаты по всем образцам в статусе «Предварительный результат», либо только готовы образцы.
3. Реестр образцов
3.1. Создать реестр
Для создания реестра необходимо перейти в раздел Реестры -> Создать реестр.
В нем можно выбрать все образцы, доступные для отправки посредством создания реестра.
С помощью чек-бокса галочками выбираются нужные образцы:
После этого необходимо нажать кнопку создания реестра:
После нажатия кнопки требуется подтвердить отправку реестра с данными записями:
На следующем шаге распечатать сам реестр:
ФБУН ЦНИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора
Реестр образцов #36
Идентификатор реестра: 36
Количество проб: 6
Организация: ФБУЗ ЦГиЭ в Костромской области
Лаборатория: ФБУН ЦНИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора
Дата формирования: 20.05.2021 16:24:04
| N | Название | Номер образца | Дата забора биоматериала | Дата регистрации | ct |
| 1 | SARS-Cov-2/Russia/KOS-KOSTROMA-6854/2021 | kostSM000005 | 17.05.2021 | 20.05.2021 | 19.42 |
| 2 | SARS-Cov-2/Russia/KOS-KOSTROMA-6852/2021 | kostSM000006 | 17.05.2021 | 20.05.2021 | 16.24 |
| 3 | SARS-COV-2/Russia/KOS-KOSTROMA-6688/2021 | kostSM000007 | 10.05.2021 | 20.05.2021 | 17.57 |
| 4 | SARS-Cov-2/Russia/KOS-KOSTROMA-6647/2021 | kostSM000008 | 11.05.2021 | 20.05.2021 | 12.8 |
| 5 | SARS-Cov-2/RuSSia/KOS-KOSTROMA-6646/2021 | kostSM000009 | 11.05.2021 | 20.05.2021 | 8.36 |
| 6 | 6641 | kostSM000010 | 10.05 2021 | 20.05.2021 | 17.67 |
| ПРИМЕЧАНИЕ: | ||||||||
| Сотрудник: | <*> Курьер: | |||||||
| Подпись | ФИО | Подпись | ФИО | |||||
Полученный реестр нужно подписать и передать курьеру.
3.2. Список реестров
В данном разделе доступна история всех отправленных реестров. При нажатии на его номер можно открыть конкретный реестр и распечатать его повторно.
В самой таблице указана как дата отправки, так и дата принятия реестра.
| #30 | Отправлен | ФБУЗ ЦГиЭ в Магаданской области (magadan) | 18.05.2021 | |
| #29 | Отправлен | ФБУЗ ЦГиЭ в Липецкой области (lipetsk) | 18.05.2021 | |
| #28 | Отправлен | ЦНИИ Эпидемиологии (crie) | 14.05.2021 | |
| #27 | Отправлен | ЦНИИ Эпидемиологии (crie) | 14.05.2021 |
Реестр может находится в 2 статусах:
— «Принят»;
— «Отправлен».