Приложение 5
к МР 3.1.0272-22

ИНСТРУКЦИЯ ПО РАБОТЕ С ПРОГРАММОЙ GENOME.CRIE.RU

Интерфейс работы с образцами.

Версия 1.4.0.

Управление документом

АвторыФБУН ЦНИИ Эпидемиологии, Информационно-аналитический отдел.
Файл
Создан06.02.2021
Последнее редактирование03.03.2021
Количество страниц11

ВерсияДата измененияОписание измененияАвтор изменения
1.0.008.02.21Составлена первая версия инструкцииЕвстифеев Е.А.
1.1.010.02.21Обновлены скриншоты из программыЕвстифеев Е.А.
1.1.010.02.21Добавлено дополнительное описание при заполнении формы единичной загрузкиЕвстифеев Е.А.
1.2.003.03.21Обновлено описание полей реестра.Евстифеев Е.А.
1.3.028.04.21Добавлено описание для работы региона, выделено в отдельную инструкцию.Евстифеев Е.А.
1.4.007.05.21Обновлено описание по менюЕвстифеев Е.А.

Предназначение системы

Проект — Российская платформа агрегации информации о геноме.

Задача системы — обеспечение быстрого доступа к данным об эпидемиях и пандемических вирусах.

Реализация проекта направлена на быстрый обмен данными по вирусу, в частности, по коронавирусу, вызывающем COVID-19. Это включает генетическую последовательность и соответствующие клинические и эпидемиологические данные, связанные с вирусами человека, а также географические и иные данные, связанные с вирусами. Это позволяет исследователям понять, как вирусы развиваются и распространяются во время эпидемий и пандемий.

Предоставление доступа

Доступ представляет собой ссылку на адрес для входа, логин и пароль. Доступ предоставляется посредством электронного обмена.

Авторизация в системе

При входе в систему появляется окно с запросом на авторизацию. В окне необходимо ввести логин и пароль, предоставленные пользователю, затем нажать кнопку «Войти»:

Авторизация в системе

Основное окно программы для работы с образцами

Данное окно доступно только для авторизованных пользователей, обладающих правами по работе с образцами.

Инструкция по работе с программой genome.crie.ru

В нем доступен следующий функционал:

1. Новый образец

2. Образцы

3. Реестр образцов

3.1. Создать реестр

3.2. Список реестров

1. Новый образец

По нажатию на данный пункт открывается окно оформления нового образца:

Инструкция по работе с программой genome.crie.ru
 

После загрузки файла и заполнения данных система отобразит окно об успешности загрузки:

Инструкция по работе с программой genome.crie.ru

Затем можно сразу начать оформление нового образца, либо посмотреть результат сохранения в разделе «Образцы».

2. Образцы

Инструкция по работе с программой genome.crie.ru

В данном разделе представлены все образцы с их статусами. По мере прохождения по процессу обработки образца статус будет изменяться. В правом верхнем углу расположена кнопка «Отчеты». Она позволяет выгружать данные, которые отображены на экране, в виде отчета.

Инструкция по работе с программой genome.crie.ru

Таким образом, есть возможность сформировать отчет и получить результаты по всем образцам в статусе «Предварительный результат», либо только готовы образцы.

3. Реестр образцов

3.1. Создать реестр

Для создания реестра необходимо перейти в раздел Реестры -> Создать реестр.

Инструкция по работе с программой genome.crie.ru

В нем можно выбрать все образцы, доступные для отправки посредством создания реестра.

С помощью чек-бокса галочками выбираются нужные образцы:

Инструкция по работе с программой genome.crie.ru

После этого необходимо нажать кнопку создания реестра:

Инструкция по работе с программой genome.crie.ru

После нажатия кнопки требуется подтвердить отправку реестра с данными записями:

Инструкция по работе с программой genome.crie.ru

На следующем шаге распечатать сам реестр:

Инструкция по работе с программой genome.crie.ru

ФБУН ЦНИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора

Реестр образцов #36

Идентификатор реестра: 36

Количество проб: 6

Организация: ФБУЗ ЦГиЭ в Костромской области

Лаборатория: ФБУН ЦНИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора

Дата формирования: 20.05.2021 16:24:04

NНазваниеНомер образцаДата забора биоматериалаДата регистрацииct
1SARS-Cov-2/Russia/KOS-KOSTROMA-6854/2021kostSM00000517.05.202120.05.202119.42
2SARS-Cov-2/Russia/KOS-KOSTROMA-6852/2021kostSM00000617.05.202120.05.202116.24
3SARS-COV-2/Russia/KOS-KOSTROMA-6688/2021kostSM00000710.05.202120.05.202117.57
4SARS-Cov-2/Russia/KOS-KOSTROMA-6647/2021kostSM00000811.05.202120.05.202112.8
5SARS-Cov-2/RuSSia/KOS-KOSTROMA-6646/2021kostSM00000911.05.202120.05.20218.36
66641kostSM00001010.05 202120.05.202117.67

ПРИМЕЧАНИЕ:
Сотрудник:<*> Курьер:
ПодписьФИОПодписьФИО

Полученный реестр нужно подписать и передать курьеру.

3.2. Список реестров

В данном разделе доступна история всех отправленных реестров. При нажатии на его номер можно открыть конкретный реестр и распечатать его повторно.

В самой таблице указана как дата отправки, так и дата принятия реестра.

#30ОтправленФБУЗ ЦГиЭ в Магаданской области (magadan)18.05.2021
#29ОтправленФБУЗ ЦГиЭ в Липецкой области (lipetsk)18.05.2021
#28ОтправленЦНИИ Эпидемиологии (crie)14.05.2021
#27ОтправленЦНИИ Эпидемиологии (crie)14.05.2021

Реестр может находится в 2 статусах:

— «Принят»;

— «Отправлен».

Ответить

15 − шесть =