Инструкция по работе с программой genome.crie.ru - MED-KATALOG.SITE
Меню Закрыть

Инструкция по работе с программой genome.crie.ru

Приложение 5
к МР 3.1.0272-22

ИНСТРУКЦИЯ ПО РАБОТЕ С ПРОГРАММОЙ GENOME.CRIE.RU

Интерфейс работы с образцами.

Версия 1.4.0.

Управление документом

Авторы ФБУН ЦНИИ Эпидемиологии, Информационно-аналитический отдел.
Файл
Создан 06.02.2021
Последнее редактирование 03.03.2021
Количество страниц 11

Версия Дата изменения Описание изменения Автор изменения
1.0.0 08.02.21 Составлена первая версия инструкции Евстифеев Е.А.
1.1.0 10.02.21 Обновлены скриншоты из программы Евстифеев Е.А.
1.1.0 10.02.21 Добавлено дополнительное описание при заполнении формы единичной загрузки Евстифеев Е.А.
1.2.0 03.03.21 Обновлено описание полей реестра. Евстифеев Е.А.
1.3.0 28.04.21 Добавлено описание для работы региона, выделено в отдельную инструкцию. Евстифеев Е.А.
1.4.0 07.05.21 Обновлено описание по меню Евстифеев Е.А.

Предназначение системы

Проект — Российская платформа агрегации информации о геноме.

Задача системы — обеспечение быстрого доступа к данным об эпидемиях и пандемических вирусах.

Реализация проекта направлена на быстрый обмен данными по вирусу, в частности, по коронавирусу, вызывающем COVID-19. Это включает генетическую последовательность и соответствующие клинические и эпидемиологические данные, связанные с вирусами человека, а также географические и иные данные, связанные с вирусами. Это позволяет исследователям понять, как вирусы развиваются и распространяются во время эпидемий и пандемий.

Предоставление доступа

Доступ представляет собой ссылку на адрес для входа, логин и пароль. Доступ предоставляется посредством электронного обмена.

Авторизация в системе

При входе в систему появляется окно с запросом на авторизацию. В окне необходимо ввести логин и пароль, предоставленные пользователю, затем нажать кнопку «Войти»:

Авторизация в системе

Основное окно программы для работы с образцами

Данное окно доступно только для авторизованных пользователей, обладающих правами по работе с образцами.

В нем доступен следующий функционал:

1. Новый образец

2. Образцы

3. Реестр образцов

3.1. Создать реестр

3.2. Список реестров

1. Новый образец

По нажатию на данный пункт открывается окно оформления нового образца:

 

После загрузки файла и заполнения данных система отобразит окно об успешности загрузки:

Затем можно сразу начать оформление нового образца, либо посмотреть результат сохранения в разделе «Образцы».

2. Образцы

В данном разделе представлены все образцы с их статусами. По мере прохождения по процессу обработки образца статус будет изменяться. В правом верхнем углу расположена кнопка «Отчеты». Она позволяет выгружать данные, которые отображены на экране, в виде отчета.

Таким образом, есть возможность сформировать отчет и получить результаты по всем образцам в статусе «Предварительный результат», либо только готовы образцы.

3. Реестр образцов

3.1. Создать реестр

Для создания реестра необходимо перейти в раздел Реестры -> Создать реестр.

В нем можно выбрать все образцы, доступные для отправки посредством создания реестра.

С помощью чек-бокса галочками выбираются нужные образцы:

После этого необходимо нажать кнопку создания реестра:

После нажатия кнопки требуется подтвердить отправку реестра с данными записями:

На следующем шаге распечатать сам реестр:

ФБУН ЦНИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора

Реестр образцов #36

Идентификатор реестра: 36

Количество проб: 6

Организация: ФБУЗ ЦГиЭ в Костромской области

Лаборатория: ФБУН ЦНИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора

Дата формирования: 20.05.2021 16:24:04

N Название Номер образца Дата забора биоматериала Дата регистрации ct
1 SARS-Cov-2/Russia/KOS-KOSTROMA-6854/2021 kostSM000005 17.05.2021 20.05.2021 19.42
2 SARS-Cov-2/Russia/KOS-KOSTROMA-6852/2021 kostSM000006 17.05.2021 20.05.2021 16.24
3 SARS-COV-2/Russia/KOS-KOSTROMA-6688/2021 kostSM000007 10.05.2021 20.05.2021 17.57
4 SARS-Cov-2/Russia/KOS-KOSTROMA-6647/2021 kostSM000008 11.05.2021 20.05.2021 12.8
5 SARS-Cov-2/RuSSia/KOS-KOSTROMA-6646/2021 kostSM000009 11.05.2021 20.05.2021 8.36
6 6641 kostSM000010 10.05 2021 20.05.2021 17.67

ПРИМЕЧАНИЕ:
Сотрудник: <*> Курьер:
Подпись ФИО Подпись ФИО

Полученный реестр нужно подписать и передать курьеру.

3.2. Список реестров

В данном разделе доступна история всех отправленных реестров. При нажатии на его номер можно открыть конкретный реестр и распечатать его повторно.

В самой таблице указана как дата отправки, так и дата принятия реестра.

#30 Отправлен ФБУЗ ЦГиЭ в Магаданской области (magadan) 18.05.2021
#29 Отправлен ФБУЗ ЦГиЭ в Липецкой области (lipetsk) 18.05.2021
#28 Отправлен ЦНИИ Эпидемиологии (crie) 14.05.2021
#27 Отправлен ЦНИИ Эпидемиологии (crie) 14.05.2021

Реестр может находится в 2 статусах:

— «Принят»;

— «Отправлен».

Добавить комментарий

Ваш адрес email не будет опубликован. Обязательные поля помечены *